CÁNCER COLORECTAL
Un 40% de los tumores colorectales metastásicos son portadores de alguna mutación en los codones 12 o 13 del exón 2 del gen KRAS. Estas mutaciones, a excepción de la G13D, confieren resistencia al tratamiento con anticuerpos monoclonales anti-EGFR (cetuximab o panitumumab). A raíz de estudios expuestos en el congreso de la Sociedad Americana de Oncología Clínica (ASCO) 2013, se ha ampliado el estudio del gen KRAS para incluir los exones 3 (codón 61) y 4 (codón 146) y los exones 2 (codones 12 y 13), 3 (codones 59 y 61) y 4 (codones 117 y 146) de NRAS, en carcinomas colorrectales con KRAS no mutado en el estudio del exón 2 realizado hasta el momento. Estos nuevos estudios permiten seleccionar mejor a aquellos pacientes que no responden a terapias con anticuerpos anti-EGFR.
Descripción de la técnica:
Detección de deleciones, inserciones, inversiones y sustituciones en targeted-regions y hotspot en 22 genes (EGFR, ALK, ERBB2, ERBB4, FGFR1, FGFR2, FGFR3, MET, DDR2, KRAS, PIK3CA, BRAF, AKT1, PTEN, NRAS, MAP2K1, STK11, NOTCH1, CTNNB1, SMAD4, FBXW7 y TP53) mediante secuenciación masiva.
Amplificación de librerías de DNA mediante PCR con el kit Oncomine Solid Tumour DNA. Cuantificación de las librerías con Ion Library TaqMan Quantitation Kit. PCR en emulsión, enriquecimiento de ISPs y carga del chip en Ion Chef System. Secuenciación masiva en Ion Personal Genome Machine (PGM) System. Análisis con IonReporter 5.2. ThermoFisher Scientific software.
Tipo de muestra: Tejido tumoral en parafina.